Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3pxd2aO89032 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3pxd2aO89032 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3pxd2aO89032 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3pxd2aO89032 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms