Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ShdO88834 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ShdO88834 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShdO88834 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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