Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BlmO88700 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms