Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms