Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top3aO70157 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3aO70157 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms