Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ldb2O55203 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms