Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms