Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc3O55013 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms