Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms