Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DffaO54786 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DffaO54786 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DffaO54786 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms