Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CaluO35887 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms