Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stag2O35638 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stag2O35638 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms