Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccrl2O35457 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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