Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrt1O35449 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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