Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn1O35350 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn1O35350 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn1O35350 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn1O35350 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn1O35350 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Capn1O35350 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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