Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms