Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NmiO35309 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NmiO35309 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NmiO35309 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NmiO35309 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NmiO35309 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NmiO35309 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms