Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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