Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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