Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Epha8O09127 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epha8O09127 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms