Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Degs1O09005 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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