Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra2O08842 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms