Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MttpO08601 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MttpO08601 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MttpO08601 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MttpO08601 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MttpO08601 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MttpO08601 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MttpO08601 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MttpO08601 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MttpO08601 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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MttpO08601 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MttpO08601 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MttpO08601 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MttpO08601 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MttpO08601 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MttpO08601 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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MttpO08601 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms