Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms