Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Gm21887J3QQ04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm21887J3QQ04 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms