Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm2056J3QQ02 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms