Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms