Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8356J3QPD3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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