Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lipo1J3QME6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lipo1J3QME6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms