Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6594J3QM43 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms