Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms