Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
7530416G11RikJ3QJX6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms