Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pnmal2G3X9N3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnmal2G3X9N3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms