Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3G3X939 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3G3X939 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms