Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r85G3UW56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms