Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
N4bp2F8VQG7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
N4bp2F8VQG7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms