Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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