Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms