Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rhox13F6YCR7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rhox13F6YCR7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox13F6YCR7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms