Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms