Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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