Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6619F6URP1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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