Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm17555F6U8B9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms