Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms