Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc7bE9Q9Y3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc7bE9Q9Y3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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