Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm3127E9Q9P5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3127E9Q9P5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
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Gm3127E9Q9P5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm3127E9Q9P5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3127E9Q9P5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms