Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srsf11E9Q6E5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms