Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ccdc171E9Q1U1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc171E9Q1U1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc171E9Q1U1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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