Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp558E9Q1J0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp558E9Q1J0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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