Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms